Trong giai đoạn đầu sáng tác Mahō Sensei Negima!, tác giả Akamatsu Ken bắt đầu sử dụng những yếu tố phông nền CG dành cho những hình ảnh như đám đông, nhà cửa... và một số vật thể khác. Nhiều công trình trong manga được vẽ dựa trên những công trình kiến trúc có thật trên thế giới, ví dụ như cây cầu Brooklyn Bridge hay Tòa thị chính Belfast. Chúng được thể hiện dưới dạng 3D, sau đó các nhân vật sẽ được vẽ lên trên cái nền 3D ấy. Nhiều mẫu tòa nhà ấy được trình bày khá chi tiết trong phần phụ lục của quyền truyện.

Phiên bản tiếng Anh của manga Mahō Sensei Negima! được Del Rey Manga mua bản quyền phát hành ở Hoa Kỳ và Canada. Ngoài ra, Mahō Sensei Negima! cũng được mua bản quyền phát hành ở nhiều quốc gia khác với nhiều phiên bản ngôn ngữ khác nhau: Nhà xuất bản Đông Lập (Tong Li Comics) phát hành ở Hồng Kông, Nhà xuất bản Sáng Nghệ (Chuang Yi Publisher) ở Singapore, Play Press Publishing ở Ý, Pika Édition ở Pháp, Egmont Manga & Anime ở Đức, Schibsted Forlag ở Na Uy, Glénat ở Tây Ban Nha, Editora JBC ở Brasil, Tanoshimi ở Vương quốc Anh, Algoritam ở Croatia và Level Comics (PT. Elex Media Komputindo), một phần của Nhóm Gramedia ở Indonesia.

Tại Malaysia, phiên bản tiếng Mã Lai của Mahō Sensei Negima! ('Magic Teacher! Ahli Magik Negi Magi') được dịch lại sang tiếng Trung. Tên của nhiều nhân vật được thể hiện theo tiếng Trung, ví dụ Kagurazaka Asuna được viết thành Shenlao Asuna, còn Konoka được chuyển thành Munai Xiang. Thậm chí, tên của tác giả "Akamatsu Ken" cũng bị chuyển thành "Chesong Jian" – nhưng thật ra "Chesong Jian" là cách đọc theo phiên âm pinyin của "Akamatsu Ken" Chesong Jian - Xích Tùng Kiện (赤松 健, Chesong Jian - Xích Tùng Kiện?). Kể từ tập 15 trở đi, tên các nhân vật được sửa lại đúng với nguyên bản.

Nội dung của Mahō Sensei Negima! được chia làm nhiều phần:

1. The Child Teacher Arc (Thầy giáo nhí) - Sau khi được giao nhiệm vụ, Negi Springfield trở thành thầy dạy tiếng Anh và là chủ nhiệm của lớp nữ 2A ở học viện Mahora. Trọng tâm của phần này chủ yếu giới thiệu về các học sinhg lớp 3A và nói về sự phát triển của mối quan hệ giữa Negi và Asuna. Một số nhóm học sinh được "chú ý" nhiều hơn các nhóm khác, ví dụ biệt động Baka Rangers, các nữ sinh trong Câu lạc bộ Thể thao, Sports girls, và một số nhân vật khác như Konoka, Ayaka và Chisame. Phần này bao trùm chương 1-15 (manga) và tập 1&2.
2. Evangeline Arc - (Evangeline, hay còn gọi là Partner Saga (phần Bạn đồng hành) as Akamatsu calls it)- Sau khi chính thức trở thành thầy chủ nhiệm lớp 3A, Negi bắt đầu gặp phải thử thách đầu tiên: tham gia vào một trận đánh với một vampire bất tử tên là Evangeline A.K. McDowell và một người máy mang tên Karakuri Chachamaru, cả hai đều là học sinh lớp 3A do Negi chủ nhiệm. Hệ thống thẻ bài Pactio, con chồn biết nói Chamo, bạn thân của Negi, cũng xuất hiện trong phần này, cùng với câu "chuyện tình" và "mối thù" trong quá khứ giữa Evangeline với Nagi Springfield, cha của Negi. Và cũng trong phần này, Asuna đã trở thành "bạn đồng hành" của Negi thông qua hệ thống thẻ bài Pactio để có thể cùng chiến đấu với cậu. Phần này bao trùm chương 16-25 (manga) và tập 3.
3. Kyoto Field Trip Arc (Chuyến đi nghỉ ở Kyoto) - Theo một chỉ dẫn, Negi tổ chức một chuyến đi chơi đến Kyoto cho lớp 3A với mục đích tìm hiểu thêm thông tin về cha mình, nhưng anh bị tập kích bởi một nhóm pháp sư phương Đông. Phần này chủ yếu nói về Konoka, cụ thể là về mối quan hệ giữa gia đình Konoka với bạn học cô, Sakurazaki Setsuna. Phần này cũng nói về tình cảm của Miyazaki Nodoka đối với Negi, cũng như tình cảm tương tự của Asaye Yue, người bạn thân của Nodoka, với Negi. Cuối phần này Nodoka, Setsuna, và Konoka trở thành "bạn đồng hành" của Negi trong hệ thống bài Pactio. Tuy nhiên không khí và tình tiết truyện trong khúc cuối của phần này đột ngột thay đổi khá nhiều: trở nên gay cấn và có nhiều pha hành động hơn. Các nút thắt và xung đột trở thành yếu tố chính của cốt truyện, và phần này trở thành bước ngoặt thay đổi toàn bộ không khí và mạch truyện (thể hiện rõ nhất trong chương 45). Trong phần này một nhân vật phản diện xuất hiện là Fate Averruncus. Phần này bao trùm chương 26-53 (manga) và anime tập 4&5.
4. Training/Wilhelm Arc (Luyện tập/Wilhelm) - Sau chuyến đi ở Kyoto, Negi thấy rằng sức mạnh của mình vẫn còn yếu kém và bắt đầu luyện tập dưới sự chỉ dẫn của một vài học sinh của mình, với mục đích để trở nên mạnh mẽ hơn. Trong khi đó một kẻ thù cũ xuất hiện tại trường Mahora, còn đối thủ của Negi, Inugami Kotaro tái xuất hiện với một gia đình mới. Cũng trong phần này, nhóm bạn chiến đấu của Negi cũng dần dần hình thành với sự gia nhập của Makie, Chizuru và Natsumi. Wilheim, giống như Fate Averruncus, chỉ là một con chốt trong tay của một "con cá lớn hơn và tệ hại hơn", nhưng chưa được đề cập tới. Phần này bao trùm chương 54-71 (manga).
5. The School Festival (Lễ hội liên hoan tại trường) Phần này bao trùm chương 72-168. Bao gồm các tiểu phần:
   • Pre-Festival (Trước lễ hội): Phần này bắt đầu với việc trường Mahora tổ chức một lễ hội thường niên chào mừng cây đại thụ World Tree trong ngôi trường. Tất nhiên lớp 3A của thầy Negi thì chuẩn bị lễ hội theo cách riêng của họ. Nhiều nhân vật mới được giới thiệu, và một trong số những học sinh lớp 3A đang có dấu hiệu chuẩn bị cho một kế hoạch rất lớn. Sức mạnh của cây đại thụ World Trê cũng được giới thiệu trong phần này. Phần này bao trùm chương 72-80.
   • Festival - Day 1 (Lễ hội - ngày thứ nhất): Với sự giúp đỡ của cỗ máy thời gian Casseopeia (phát minh mới nhất của Siêu Linh Âm), Negi trong một thời gian ngắn ngủi đã có thể tham gia rất nhiều hoạt động của lớp 3A trong buổi lễ, ví dụ như tham gia tiết mục "căn nhà ma", đi tuần với 2 học sinh, hẹn hò với 3 trong số đó, thậm chí giúp đỡ một học sinh trong cuộc thi biểu diễn thời trang! Thậm chí Negi cũng tham gia vào vòng sơ tuyển của cuộc thi đấu võ thuật tại trường Mahora. Phần này bao trùm chương 81-87.
   • Mahora Martial Arts' Tournament (Cuộc thi đấu võ thuật tại trường Mahora): Sau khi lọt vào top 16, Negi chiến đấu với những địch thủ quen biết và không quen biết để vào trận chung kết, bao gồm thêm 1 thành viên khác của nhóm Huyết Vũ. Trong khi đó, Asuna dần dần khám phá ra thêm những bí mật về quá khứ của cô, và Chao bắt đầu triển khai kế hoạch của mình, và đang bị các bảo vệ, từ Takamichi và Setsuna đến Misora, truy nã cô. Phần này bao trùm chương 81-119.
   • Festival - Day 2 (Lễ hội - ngày thứ nhì): Sau cuộc thi đấu võ thuật, Negi tiếp tục tham gia vào nhiều hoạt động nữa của lễ hội trường Mahora. Tiểu phần này chú trọng vào việc Ako hẹn hò với Negi (trong hình dạng người lớn với "tên giả" Nagi), về hoạt động của các nữ sinh thuộc Câu lạc bộ Thư viện (Library Club), và tình bạn giữa Chisame và Chachamaru. Cuối tiểu phần, Yue và Haruna lần lượt trở thành bạn đồng hành thứ năm và thứ sáu của Negi trong hệ thống Pactio. Phần này bao trùm chương 120-131.
   • Chao's Mission & Eight Days Later (Nhiệm vụ của Siêu Linh Âm và tám ngày tiếp theo): Khi kế hoạch của mình đã hoàn tất và thời cơ đã chín muồi, Siêu Linh Âm chạm mặt với Negi trong một trận đấu mà kết cục hoàn toàn bất ngờ. Nhưng chưa hết, nhiều diễn biến phức tạp sau đó đã đưa Negi cùng các đồng đội vào một thế giới mà họ không bao giờ nghĩ là nó có thể tồn tại. Phần này bao trùm chương 132-144.
   • The Battle of Mahora (Trận chiến tại Mahora): Nhóm của Negi "vượt ngục" thành công và trở về thời điểm trước khi Siêu Linh Âm thực hiện kế hoạch của mình để ngăn chặn cô. Trong tiểu phần này, Chisame cũng trở thành bạn đồng hành thứ bảy của nhóm Negi trong hệ thống Pactio. Phần này bao trùm chương 145-162.
   • Post-Festival (Sau lễ hội): Sau lễ hội Mahora, Negi quyết định trở về Wales nhằm tìm hiểu bí mật về cha mình cũng như mối quan hệ giữa ông và Asuna. Sau đó là một số tình tiết liên quan tới Misora, Yuna và Akira. Phần này bao trùm chương 145-162.
6. Journey to the Magic World (Hành trình tới Ma Pháp Quốc) Phần này bao trùm chương 169-nay. Bao gồm các tiểu phần:
   • Preparations (Chuẩn bị): Negi và các đồng đội/học trò của mình lập nên một nhóm gọi là Ala Alba (Bạch Vũ) và chuẩn bị chuyến hành trìn vào thế giới phép thuật để tìm hiểu bí mật về Nagi. Cùng đi với nhóm của Negi là Anya, bạn thời thơ ấu của cậu, cùng với Yuna, Ako, Akira, Makie, Natsumi (bốn người này tình cờ lạc theo Negi). Phần này bao trùm chương 169-185.
   • Separation (Bị chia cắt): Khi cả nhóm vừa mới chân ướt chân ráo đến thế giới phép thuật, nhóm của Fate Averruncus tập kích họ, kết quả là cánh cổng dẫn đến thế giới phép thuật bị phá hủy và nhóm của Negi mỗi người lạc một nơi. Tệ hại hơn là cả nhóm Negi lọt vào danh sách truy nã của các chính quyền thế giới phép thuật. Negi và Kotarō buộc phải tham gia một cuộc thi đấu phép thuật trong hình dạng người lớn và (riêng Negi còn phải dùng tên của cha mình, Nagi) với mục đích thông báo cho cả nhóm về vị trí và tình trạng hiện giờ của mình. Việc này đã đạt được kết quả tốt: mọi người dần dần tề tựu đông đủ tại phế tích của cố đô Ostia. Phần này bao trùm chương 186-200.
   • Reunion (Đoàn tụ): Negi bắt đầu quá trình tập luyện dưới sự hướng dẫn của sư phụ Rakan, một người bạn cũ của cha mình, Nagi. Để có được sức mạnh nhằm đánh bại Fate và bảo vệ bạn bè của mình, Negi quyết định từ bỏ luyện tập ma thuật theo con đường "chính đạo" như cha mình mà theo đuổi ma thuật Hắc Ám, giống như sư phụ Evangeline, điều này giúp sức mạnh của cậu tăng vọt, nếu thành công, nhưng cậu sẽ mất tất cả nếu thất bại. Cuối cùng Negi đã thành công. Trong phần này, Kazumi trở thành bạn đồng hành thứ 8 của Negi trong hệ thống Pactio. Trong khi đó, những đồng đội của Negi đã dần thích nghi với thế giới phép thuật và phần lớn tất cả mọi người đều đã tề tựu đông đủ (trừ Asaye Yue tạm thời bị mất trí nhớ). Phần này bao trùm chương 201-220.
   • Ostia Festival - Day 1 (Lễ hội Ostia - ngày 1): Phần này mở đầu với sự kiện lễ hội kỷ niệm 20 năm ngày kết thúc cuộc chiến tranh khủng khiếp trong thế giới phép thuật giữa đế quốc Hellas và Liên bang Cộng hòa. Sau đó, Fate Averruncus và Negi gặp nhau và Fate đề nghị Negi đừng can thiệp vào âm mưu của y tại thế giới phép thuật, đổi lại Fate sẽ để cho Negi cùng các học trò của cậu trở về nhà an toàn. Negi tỏ ra dao động trước thỏa thuận của Fate, nhưng Asuna kiên quyết không hợp tác với Fate và kết quả là Negi từ chối thỏa hiệp. Cuộc đàm phán nhanh chóng tan vỡ và một trận đánh nhau quyết liệt giữa nhóm của Fate và nhóm của Negi bùng nổ cho đến khi Rakan xuất hiện và Fate buộc phải rút lui. Không may là trong trận đấu, Asuna bị thủ hạ của Fate bắt cóc cùng với Anya, trong khi đó một Asuna giả mạo được Fate cài vào nhóm của Negi để thăm dò động tĩnh của nhóm. Sau trận đánh, cả nhóm được Rakan kể về câu chuyện của cuộc chiến tranh 20 năm trước, về việc Nagi, Rakan và các đồng đội đã cứu vãn thế giới phép thuật khỏi cuộc chiến tranh tàn khốc, qua đó hé lộ một số bí mật về Nagi. Sự kiện cuối cùng của phần là Kaede trở thành đồng đội thứ 9 của Negi trong hệ thống thẻ bài Pactio. Phần này bao trùm chương 221-234.
   • Ostia Festival - Day 2 (Lễ hội Ostia - ngày 2): Nhóm Negi và Kotaro liên tiếp chiến thắng trong các trận tranh tài của cuộc thi đấu phép thuật trong lễ hội Ostia và trở thành ứng cử viên nặng ký cho chức vô địch, tuy nhiên hy vọng giành được ngôi quán quân cũng như giải thưởng gần như tiêu tan khi sư phụ Rakan cũng tham gia cuộc thi đấu (với mục đích chính là kiểm tra sự tiến bộ của nhóm Negi, Kotaro). Mặc dù vậy, cả hai vẫn không nản chí và tiếp tục luyện tập cật lực dưới sự huấn luyện tận tình sư phụ của Evangeline cùng với những người đồng đội cũ của Rakan và Nagi (trong đó có Công chúa Theodora của Đế quốc Hellas, người sau này trở thành "bạn đồng hành" với Negi trong hệ thống thẻ bài Pactio). Phần này bao trùm chương 236-239.
   • Ostia Festival - Day 3 (Lễ hội Ostia - ngày 3): Negi và Kotaro hoàn tất chương trình luyện tập và đấu với nhóm của Rakan trong trận chung kết. Trong lúc đó, chúng ta được biết là trước trận đấu, tình cờ Ako đã biết được rằng thật ra "Nagi" chính là "phiên bản" người lớn của cậu bé Negi Springfield. Kết quả trận đấu là hai bên hòa nhau và Negi chỉ giành được một nửa số tiền thưởng, nhưng sau đó Rakan đã giao toàn bộ phần tiền thưởng còn lại của cuộc thi đấu cho Negi để cậu có đủ tiền giải phóng Ako, cũng như Akira và Natsumi khỏi thân phận nô lệ. Phần này bao trùm chương 240-249.
   • Post-Festival (Sau lễ hội): Sau khi giải phóng Ako, Akira, Natsumi, Negi và cả nhóm tiếp tục theo đuổi mục tiêu truy tìm những thành viên thất lạc để tất cả mọi người cùng trở về an toàn. Negi và Nodoka sau đó đã tìm được Yue, còn Setsuna trở thành "bạn đồng hành" của Konoka tronh hệ thống bài Pactio. Trong khoảng thời gian đó Negi chạm trán và đánh nhau với Kurt Gödel, Thống đốc của Ostia và là một cựu thành viên của Ala Rubra. Trong trận đánh này, Kurt đã hé lộ thân phận của mẹ Negi cũng như những bí ẩn tồn tại trong gia đình của Negi. Phần này bao trùm chương 250-255.
   • The Governor's Ball (Bữa tiệc của nhà cầm quyền): Kurt Gödel sau đó mời nhóm của Negi (tất nhiên dưới thân phận "giả" là đấu sĩ Nagi) tham gia một bữa tiệc tổ chức bởi chính quyền Ostia, đổi lại ông ta hứa sẽ bãi bỏ lệnh truy nã nhóm của Negi và tiết lộ toàn bộ sự thật về song thân của Negi. Trong thời gian đó, cả nhóm phát hiện hành tinh của ra thế giới phép thuật Mundus Magicus rất giống với Sao Hỏa, và kết luận rằng thế giới phép thuật là phiên bản của Sao Hỏa ở một thế giới song song. Khi cả nhóm đặt chân đến bữa tiệc, Jack Rakan phát hiện và chạm trán với nhóm của Fate Averruncus. Trong khi đó tại bữa tiệc, Ku Fei trở thành "bạn đồng hành" Pactio thứ mười của Negi, và Natsumi cũng trở thành "bạn đồng hành" đầu tiên của Kotaro. Phần này bao trùm chương 256 trở đi.

Phiên bản tiếng Anh

Mahō Sensei Negima! bị vướng vào một tin đồn xung quanh việc bản manga tiếng Anh bị kiểm duyệt ở Bắc Mỹ, nguyên do là các truyện của Akamatsu mang nhiều yếu tố hài hước đến mức suồng sã, và đặc biệt là mang nhiều chi tiết fan service hơi nặng về tính kích dục. Các fan, ban đầu đã rất bất bình trước tin tức những "chỉnh sửa" của nhà xuất bản Del Rey nhằm cắt bỏ những yếu tố trên, nay với tin bị kiểm duyệt này họ lại càng tức giận hơn nữa và phản đối quyết liệt. Cuối cùng, một giải pháp dung hòa được đưa ra: Mahō Sensei Negima! sẽ không bị kiểm duyệt ở Bắc Mỹ nhưng những quyển truyện này sẽ bị "đánh dấu" bằng cách buộc chặt nó lại, điều này vẫn khiến nhiều người không hài lòng vì sợ việc buộc chặt sẽ làm hỏng quyển truyện.[8] Rồi từ tập 14 trở đi, phiên bản tiếng Anh Mahō Sensei Negima! cũng không còn bị "đánh dấu" nữa.

Tiếp đó, Del Rey lại phát hành một bản dịch 100% của các omake trong phiên bản gốc tiếng Nhật (bao gồm các bản vẽ phác các nhân vật, fan art, và thông tin về ngôn ngữ, cách chơi chữ cũng như các thông tin khác), cùng với nhiều thông tin về văn hóa Nhật Bản và những thông tin thú vị khác không xuất hiện trong bản omake gốc.